En 1913 la Revolución empieza a castigar a Salamanca, muchos hombres son enrolados en las filas y quedan los hogares desamparados.

En Abril de 1915, El Coronel Francisco Villa junta en Salamanca a toda su gente aproximadamente 8,000 soldados para dirigirse a Celaya en donde es derrotado por las fuerzas del General Álvaro Obregón. Derrotadas las fuerzas Villistas vuelven a pasar por Salamanca, perseguidos por el Ejercito, los soldados de Obregón toman Salamanca y permanecen 8 días. Después se dirigieron a la ciudad de León Gto.

En Julio del mismo año, Salamanca es azolado por el General Fierro uno de los hombres fuertes de Villa.

Pocos días después llegó a Salamanca, el ejercito Carrancista bajo el mando del Gobernador del Estado y Salamanca se tiñe de sangre con el fusilamiento de 12 personas en pleno jardín principal.

Debido a las continuas luchas en el municipio, donde quedaban animales muertos y quizás también personas que no eran sepultadas, se desató la epidemia del Tifo.

La Carestía, los Asaltos, las epidemias, Salamanca, sufría seriamente, cuando la noche del 10 de Febrero de 1918 varias gavillas de Villistas volvieron a atacar Salamanca, saqueando negocios, vejando ciudadanos y llevándose todo lo que pudieron de las casas particulares.

Para colmo de desdichas a fines de año los habitantes de Salamanca, fueron atacados por la epidemia mundial llamada "Influenza Española".

En el año de 1924 fue terminado el Templo del Señor del Hospital, y el Cristo Negro que se encontraba en el Templo Expiatorio, fue colocado en el lugar que hoy se encuentra; El Templo fue consagrado con una ceremonia que oficiaron: el Arzobispo de Michoacán Leopoldo Ruíz y flores, el Obispo de Michoacán Luis Martínez, el Obispo de León Emeterio Valverde, el de Querétaro Francisco Banegas, el de Tacámbaro Leopoldo Lara y aproximadamente 20 curas de diferentes parroquias.

En el año de 1938 a 1939, se construye en Salamanca una gran industria de alimentos enlatados "La Fortaleza" que durante muchos años fue la principal fuente de empleos del municipio. Se construyó también el Puente "Blanco" o "El Molinito", esta magnífica obra arquitectónica se llevó a cabo en tan solo seis meses de trabajos con presupuesto federal.

El Primer mercado municipal fue inaugurado en 1942 por el Presidente Municipal Carlos Espinoza Partida, se construyó en una explanada frente al templo de San Agustín, mismo sitio que ahora ocupa la plaza Hidalgo.

El 24 de Septiembre de 1945, el Presidente de la República, Manuel Ávila Camacho publicó en el diario de la Federación un decreto en el que se ordena la adquisición de todo lo necesario para instalar en la ciudad de Salamanca, municipio de Guanajuato, una refinería que solucionará la imperiosa necesidad de distribuir con prontitud los productos derivados del petróleo y que a la vez se diera un impulso importante a la industrialización en el centro del país.

La llegada a Salamanca de los primeros trabajadores de la refinería de dio en el año de 1945 y entre los primeros en llegar se encontraban los funcionarios sindicales: Jorge Mújica, Luis de la Fuente, Pancho Torres, Manuel de la Fuente y Carmelo Servin acompañados de 200 familias de trabajadores de la industria petrolera, algunas familias se instalan en el Exconvento Agustino. Y en 1946 varios dirigentes del Sindicato de Trabajadores Petroleros de la República Mexicana, instalan la primera tienda sindical.

El 30 de Julio de 1950, el Lic. Miguel Alemán, Presidente de la República inauguró la Refinería "Ing. Antonio Manuel Amor". La cual contaba con 6 plantas, 4 calderos, 4 generadores de energía eléctrica talleres, oficinas, laboratorio, almacén y un aeropuerto, y durante ese año comenzó la producción de gasolinas, kerosina, diesel y otros productos.

En el año de 1953 el gobierno del Estado decreta la autorización para la introducción del sistema de alcantarillado y drenajes en la ciudad de Salamanca. Iniciando con esto la pavimentación de sus calles con apoyo de la Refinería Ing. Antonio M. Amor, la Presidencia Municipal es remodelada y se le coloca piso de mosaico. En éste año también fue adquirida la primera camioneta para traslado de carne del rastro municipal.

Tal pareciera que Salamanca recobraría el apogeo económico que tuvo en el siglo pasado, pero otra catástrofe volvió a azotar al municipio, la inundación causada por el río Lerma el 21 de Septiembre 1958, con la cual se perdieron las cosechas de maíz y sorgo, debido a la magnitud de este desastre, se formó un comité pro damnificados, presidido por Don Octavio Arredondo, se levantaron albergues a un costado de la carretera Salamanca-Valle de Santiago y se construyó un bordo en el Río Lerma con la finalidad de proteger a la población de futuras calamidades.

Con la finalidad de solucionar el problema vial que ocasionaba la vía del ferrocarril entre la colonia Bellavista y el centro de Salamanca, se construyó en 1965 un paso a desnivel, siendo presidente Municipal el Dr. Luis Aurelio Sánchez Pérez, a éste paso se le llamó "Héroes de la Reforma" y es el que se encuentra en la calle Zaragoza. En éste año, también se instaló el alumbrado Mercurial en once kilómetros de calle.

Durante éste año, se inició la escuela Superior de Ingeniería Mecánica y Eléctrica. Y la escuela de Técnicos diesel e instrumentistas, convirtiendo a Salamanca en un centro productor de técnicos para todo el país.

En 1965 el Exconvento de San Agustín alberga la primera escuela de Bellas Artes, el "Instituto Regional de Bellas Artes".

En el año de 1968 visitan la ciudad en gira de trabajo, el Presidente de la República, Gustavo Días Ordaz y el Lic. Luis Echeverría Álvarez.

En el año de 1973 las abundantes lluvias que se presentaron causaron alarma entre los Salmantinos, quienes motivados por el Presidente Municipal, el Arq. Carlos Arredondo García, reforzaron siete kilómetros de bordo en las márgenes del Río Lerma.

En el año de 1982 con aportación de los industriales y comerciantes de Salamanca, se construyó un nuevo puente sobre el Río Lerma, con el cual se mitigó un poco el problema vial entre la zona sur de Salamanca y las zonas norte y centro.

En ésta año, siendo presidente Municipal Carlos Muñoz Mosqueda, se construyó el primer boulevard, "Prolongación Hidalgo" en la salida de Salamanca, rumbo a Celaya.

En el año de 1983 se da en Salamanca un gran crecimiento urbanístico, siendo presidente Municipal Rogelio Gutiérrez Solórzano una de las obras más importantes fue el libramiento carretero que rodea a la población por el lado Sur, y en el cual hubo la necesidad de construir tres puentes sobre el río Lerma. La construcción de la Avenida Faja de Oro y el traslado del Mercado Tomasa Estévez unas calles más al norte para construir el estacionamiento subterráneo "Morelos", ubicado enfrente del Exconvento Agustino y sobre de él la plaza Hidalgo con lo cual cambio radicalmente la imagen urbana de Salamanca.

En éstos años también se remodeló el parque llamado "El Árbol", que se encuentra a espaldas del Templo Agustino, y fue construido en esas instalaciones un teatro al aire libre, El Municipio adquirió la esquina de Albino García y Juárez, para convertir en museo la casa desde donde el Padre Hidalgo exhortó al pueblo y fue construido el boulevard Morelos, y se asfaltaron varios caminos de las comunidades más importantes del Municipio, Valtierrilla, la Ordeña y Cerro Gordo entre otros. Agilizando con esto la comunicación entre un importante sector de producción.

En 1986, siendo presidente municipal el C. Victor Deschamps Contreras, fue construida la primer Central de Autobuses de Salamanca.

En 1993 Salamanca cuenta con un Eco parque proyectado para contrarrestar los estragos ecológicos de las industrias y ser un importante pulmón para la ciudad y es restaurado el Claustro Menor del Exconvento Agustino, en éste tiempo era presidente municipal el Ing. Juan Manuel González García.

En el año de 1997 es terminada la construcción del centro de readaptación social ubicado al sur de la ciudad, cercano a la comunidad de Uruétaro, siendo presidente municipal el Lic. Agustín Marmolejo Valle.

Durante la Gestión del Lic. Samuel Alcocer Flores como Presidente Municipal, en el año 2000 fue construido el paso a desnivel de la calle Álvaro Obregón. Y se inició la remodelación del Claustro Mayor del Exconvento San Agustín.

En la gestión del C. José Justino Arriaga Silva se construye el puente gemelo "El Molinito" y conluye la obra de remodelación del Claustro Mayor del Exconvento de San Agustín.